本作为大家描述在母港里生活的各位舰船的日常生活。一句话剧情这是个冠上舰船名称的少女们所生活的世界，而且与「现在」的世界有点不同。她们隶属于许多势力同心协力组成的联合组织「碧蓝航线」。舰船们都在设置于母港里的「学园」生活。主角标枪、绫波、Z23与拉菲，在这个与不同阵营的舰船们一起生活。每个阵营的每个舰船，个性都不太一样、身材也都不太一样，而且都很独特，她们在「碧蓝航线」会编织出什么样的故事呢？...

为碧蓝的航线献上祝福—— 「碧蓝航线」的少女们， 击退了从世界之外而来的神秘敌人「塞壬」的大攻势 但，战争不管到了何时，都不会有变化。 正如当初人类争夺海上霸权一般， 「碧蓝航线」与「赤色中轴」因理念不同而对立。 之后，时光流逝——...

宇宙中的一场爆炸让地球上的熊类发生了暴走，身强体壮的熊类很快就让人类伤亡惨重，一场旷日持久的人熊之战就此拉开序幕为了生存，人类建起了高耸的墙壁，将熊隔离在了墙壁之外。然而，他们并不知道的是，在这个世界上，危险的并不仅仅是那些凶猛强壮的野兽们。 岚丘学园学院中，来了两名转校生，她们是百合城银子（荒川美穂 配音）和百合咲露露（生田善子 配音），表面上看来，她们只是柔软可爱的女孩子，然而，两人的真实身份...