某年夏天，六年级小学生裕太（武井证配音）独自来到位于深山的萤之丘水库。当年他曾和父亲来到这里捉独角仙，一年前父亲意外去世，曾留下无数美好回忆的水库，对他来说自然别有一番意义。在此期间，他遭遇罕见的暴雨，结果不小心跌落水库。幸运的是裕太成功获救，在一个古色古香的小村庄里，他结识了可爱天真的小女孩纱荣子（木村彩由实配音）。偶然间裕太发现，自己正身处昭和25年（1950），而这里正是后来沉入水库的小村庄...

第二波“净化”开始了，石丸、樱井、岸、甲斐、李等日本政商界要人们按照名单顺序逐个被杀。然而，日本政府坚决贯彻不屈服于恐怖分子的态度。警察、对亚特选群、自卫队、美国国防部，还有亚人管理委员会官员户崎和高中生亚人永井圭，都在暗中潜伏着。亚人过激派集团也终于开始行动了。史上最恶最凶的恐怖分子佐藤的真正目的是什么？阻止佐藤的又会是谁？...

“亚人”是1980年代开始渐渐出现在人类视野之中的新人种，他们源自于人类，有着和人类一样的外貌，却有着不老不死的肉身，只有一个人类死亡之后，才能够判断他是否为亚人。人类恐惧亚人身上所蕴藏的强大力量，对他们发起了严酷的追捕和研究。永井圭（宫野真守配音）是一位平凡的少年，拥有高超的智商和优秀的成绩，某日，在一场交通事故中，永井圭不幸丧生，随后变为亚人，遭到了军方的通缉。在童年好友海斗（细谷佳正配音）的...

某天，普通高中生永井圭（宫野真守配音）在放学路上被卡车撞倒，短暂的死亡过后，他悠然回到人间。作为日本第三位亚人，永井被警察、亚人管理委员会乃至赏金猎人等多方势力盯上。与此同时，被亚人管理委员会称为“帽子”的佐藤（大冢芳忠配音）将受控的亚人田中功次（平川大辅配音）。他向全国范围内发出信息，最终集结了7名亚人。佐藤试图策划大规模的虐杀恐怖行动，向日本政府发起冲击。在7名亚人中，中野攻心中的疑惑与日俱增...

赛菲罗斯的事件已经过去2年了，人类从巨大陨石的灾难之下逃脱。曾经繁荣的都市虽然满目疮痍，但人们已经开始投入重建家园的工作之中。而拯救世界的英雄克劳德，却过着与世隔绝的生活。 但是，神秘的疾病“星痕症候群”在世界蔓延。蒂法•洛克哈特决定找寻克劳德。但当她找到克劳德之时，眼前这个人，只是一个为艾利斯之死郁郁寡欢的落魄男子。 以继承赛菲罗斯的遗志而组成的白发三人组出现在人们眼前，文森特不得不再次挥动...

在电视台打工的大学生中田正义，偶然遇到一位奇妙的俊美外国人理察后来才得知理察可是在国内外都拥有大批忠实顾客的宝石商。因缘际会之下，正义决定请理察鉴定祖母留下来的粉色蓝宝石。藉由这颗宝石，祖母生前的秘密也逐渐被揭开……...

战国时代，号称霸王的织田信长，在现代日本复活了但，却是以柴犬的样貌！与信长同时代的战场名将们，也全都转生成了狗。现代的群雄割据，是在遛狗场中……！？...

在我旁边有暗黑破坏神...

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由游戏原作1~3章剧情，再构成改编的全新故事...